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诚信经营质量保障价格合理服务贴心很多实验室做电转的方式是这样的:
第一次问同事参数。
第二次查论文。
第三次根据感觉加一点电压。
第四次觉得细胞死得多,再降一点。
经过十几次实验以后,终于得到一个还不错的结果。
但是过了两个月,换一个人重新做,又开始从头试。
这说明实验室获得了一组参数,却没有真正建立电转参数优化体系。
对于长期进行细胞转染、基因编辑以及核酸递送的实验室来说,更有价值的不是“记住一个数字",而是形成一套能够重复使用的方法。
每次电转至少保存几类信息。
细胞名称;
来源;
培养状态;
代次;
电转前活率;
细胞数量。
质粒DNA、mRNA、siRNA还是CRISPR RNP;
加入量;
样品浓度;
必要的质量信息。
电转缓冲液;
反应体积;
电转杯规格。
波形;
电压;
脉冲时间;
脉冲次数;
脉冲间隔;
以及对应设备所涉及的其他关键设置。
转染效率;
细胞活率;
有效细胞数量;
细胞状态;
后续功能结果。
只有这些信息完整记录下来,下一次实验才真正有东西可以比较。
不要只留下最终参数。
应该把失败参数也记录下来。
例如可以逐渐形成:
过弱区域;
可用区域;
最佳平衡区域;
效率优先区域;
活率优先区域;
过强区域。
这样做最大的好处是:
以后出现实验波动时,你知道应该往哪个方向调整。
而不是每次都重新猜。
Bio-Rad 的优化资料建议以现有或公开协议作为起点,并围绕波形相关参数逐步优化;Lonza 则采用程序矩阵筛选后继续细调的思路。两类方法背后的共同逻辑,都是先确定可用范围,再缩小到更适合当前目标的条件。
实验室可以为常用细胞建立三个版本。
方案A:活率优先。
适用于珍贵细胞、后续长期培养或者功能实验。
方案B:平衡方案。
效率和活率综合表现稳定,作为常规推荐条件。
方案C:效率优先。
在项目确实需要更高递送率,并且细胞能够承受的情况下使用。
这样以后遇到不同实验目标,就不需要重新做完整优化。
真正影响电转重复性的,不只有机器参数。
实验人员也属于变量。
例如:
有人细胞重悬后马上电转;
有人放了十分钟以后才开始;
有人轻柔吹打;
有人反复猛烈吹打;
有人电转后马上恢复;
有人处理完所有样品才统一加培养液。
这些流程差异都会降低参数的可复制性。
因此成熟的电转SOP不仅要写:
“电压多少,脉宽多少。"
还应该规定:
细胞怎么准备;
按照什么顺序混合;
最长等待时间如何控制;
电转完成以后如何恢复;
什么时候检测。
当操作流程标准化以后,设备参数的意义才能真正体现出来。
如果实验室长期做不同细胞和不同递送物,选择电转设备时,不能只问:
“最高电压是多少?"
更应该考虑:
参数是否能够按照实验需要进行细化调节;
是否支持当前研究所需的波形;
脉冲时间、次数等关键条件是否满足实验设计;
实验输出是否稳定;
不同批次参数是否方便重复;
参数记录是否清晰;
耗材与实验体系是否匹配;
出现参数问题以后是否能够获得应用支持。
因为真正的采购成本并不只是设备价格。
如果设备买回来以后,每一个新细胞都需要研究人员花大量样品自己摸索,那么试错时间和珍贵样品损失同样属于成本。
出现下面几种情况时,不建议继续机械使用原参数:
更换细胞类型;
更换递送物;
从质粒改成mRNA或RNP;
更换缓冲体系;
改变反应体积;
更换电转杯规格;
细胞批次差异明显;
实验效率持续下降;
活率发生明显变化;
项目从“表达验证"转向“功能研究"。
这时候应该回到已有参数窗口附近,进行针对性调整,而不是从零开始。
电转参数优化的最终价值并不是得到某一次漂亮实验结果。
而是第一次优化完成以后:
第二次更容易重复;
换批次以后知道怎么调整;
换操作者以后结果仍然稳定;
换递送物以后能够快速找到起点;
出现问题以后能够根据记录迅速判断原因。
这才说明实验已经从“碰运气试参数",进入了可控、可复制的状态。
如果实验室正在进行质粒、mRNA、CRISPR RNP、原代细胞、干细胞、T细胞、NK细胞等电转实验,在寻找参数时,可以直接整理以下信息:
实验目标 + 细胞类型 + 递送物 + 细胞数量 + 缓冲体系 + 电转杯规格 + 当前参数 + 当前效率 + 当前活率 + 希望解决的问题。
基于这些条件进行分析,再决定下一轮怎样调整,通常比单纯搜索“某某细胞多少伏"更加有效。
对于设备厂家而言,真正有价值的服务也不应该只是提供一台电转仪,而应该帮助用户把设备参数与实际细胞实验对应起来,减少试错次数,尽快找到适合自己实验体系的参数窗口。
这也是电转参数优化最终需要解决的问题。