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诚信经营质量保障价格合理服务贴心很多实验人员第一次做原代细胞、T细胞、NK细胞、PBMC或者其他难转染细胞时,会先搜索:
“某某细胞电转参数是多少?"
然后找到一篇论文或者一个实验帖子,直接复制其中的电压、脉宽和脉冲次数。
如果第一次结果不错,当然很好。
但更常见的情况是:
别人能做到的效率,自己做不到;甚至同样的参数,第一批细胞效果不错,第二批就明显下降。
这并不一定说明设备有问题。
对于原代细胞和免疫细胞来说,电转参数优化本身就应该允许一定的生物学差异存在。
公开的细胞转染数据库中,同一种细胞在不同程序、体系和样品条件下,效率和活率本身就可能存在明显差异,因此成熟的优化策略通常更强调“以已有条件作为起点,再针对实际样品细化",而不是认为存在一个适用于所有实验室的固定数字。
稳定细胞系通常经过长期培养和筛选,实验条件相对容易标准化。
但原代细胞来自实际组织或样本,其状态可能受到很多因素影响。
包括:
样本来源;
分离过程;
培养时间;
激活状态;
细胞组成;
批次差异;
实验前处理。
这些因素都可能改变细胞对电刺激的耐受性。
所以同样的400V,并不意味着两批细胞一定会得到同样结果。
对于普通细胞系,细胞损失之后通常还可以继续培养。
但是对于珍贵原代样品来说,情况不同。
尤其样本量有,如果为了追求几个百分点的阳性率,让大量细胞在电转后死亡,整个实验未必是成功的。
因此优化原代细胞时,建议优先观察:
电转后即时状态;
几个关键恢复时间点的活率;
真正存活的阳性细胞数量;
后续增殖能力;
后续功能是否正常。
单看一个“转染率80%"并不能完整说明实验质量。
以T细胞、NK细胞等为例。
研究目的通常并不是单纯让荧光蛋白表达出来。
后面往往还要做:
增殖;
细胞因子;
杀伤功能;
受体表达;
基因编辑;
其他功能分析。
如果某组条件电转效率非常高,但是细胞状态严重受损,那么后续实验数据可能同样受到影响。
所以对于这类细胞,真正需要优化的是:
可用细胞,而不是漂亮的阳性率。
假设目前有一个公开参数可以参考。
不要直接把它当最终答案。
可以把这个条件设置成中心条件,然后向相对温和和相对增强两个方向建立小范围梯度。
第一轮先回答:
这个细胞大概能够接受哪个刺激区间?
第二轮再回答:
在这个区间里,哪个条件能够提供更好的效率与活率平衡?
如果需要进一步追求高效率,可以再向效率侧细化。
如果样品特别珍贵,则可以向活率侧细化。
Lonza 的优化指南也采用类似的思路:先获得较优程序,再根据实验目标向“更高活率"或“更高效率"的方向继续细调。
这也是原代细胞电转中最现实的问题之一。
已经优化出一组参数以后,不代表以后永远不需要调整。
更实际的做法,是建立一个“参数窗口"。
例如:
核心推荐条件;
相对温和条件;
相对增强条件。
换批次以后先从核心条件开始。
如果发现细胞状态明显较弱,就向温和方向调整。
如果细胞状态很好但效率偏低,再向增强方向优化。
这样比每换一批样本都从零开始效率高得多。
很多实验的波动并不是设备参数造成的。
比如:
细胞离开培养环境的时间不同;
室温放置时间不同;
电转后加入恢复液的速度不同;
不同人员吹打力度不同。
这些细节单独看似乎很小,但是全部叠加以后,就可能造成非常明显的差异。
所以当实验进入稳定阶段以后,应当把“人"的变量尽量降低。
固定:
细胞处理方式;
细胞数量;
体系体积;
混合顺序;
电转时间;
恢复流程;
检测时间。
这样参数才真正具有可复制性。
如果希望厂家或者技术人员协助做电转参数优化,只说一句:
“我要转T细胞,给我一组参数。"
通常很难给出真正有价值的建议。
更有效的信息应该包括:
具体细胞类型;
物种及样品来源;
是否经过激活;
递送质粒、mRNA还是RNP;
细胞数量;
体系体积;
电转杯规格;
当前使用参数;
目前效率;
目前活率;
希望解决的主要问题。
信息越完整,优化方向就越明确。
对于原代细胞和免疫细胞而言,真正好的电转方案通常不是追求一个看起来非常高的数字,而是让效率、活率、功能和重复性共同达到实验可接受的水平。
这才是参数优化真正服务于科研项目的意义。