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诚信经营质量保障价格合理服务贴心“参数已经调了很多次,为什么电转效率还是上不去?"
这是电转实验中非常常见的问题。
有些实验连续提高电压,有些不断延长脉冲时间,还有一些直接照搬别人发表论文中的参数,但最后效果依然不稳定。
问题往往在于:
电转效率不是由一个参数决定的。
电转设备上的电压、脉宽只是整个实验系统的一部分。真正有效的电转参数优化,应该把细胞、递送物、缓冲体系、电转杯、脉冲条件以及恢复培养放在同一个体系中考虑。
很多人调参数时,最容易忽略的恰恰是细胞。
同一种细胞,不同培养状态下对电刺激的耐受能力可能不同。
例如细胞状态不好、出现大量死亡、培养过度、收集过程损伤严重,那么即使参数本身没有明显问题,最终实验结果也可能非常差。
所以每次电转前建议记录:
细胞来源;
培养代次;
收集前状态;
细胞数量;
活率;
是否刚经过特殊处理。
如果实验今天成功、下周失败,而机器参数一样,首先应该比较的往往不是设备,而是两批细胞是否真的处在相同状态。
质粒DNA、mRNA和CRISPR RNP,并不能简单使用相同的优化逻辑。
尤其是DNA电转,除了电刺激本身之外,还应关注样品纯度和实际加入量。
并不是加入越多,结果就一定越好。
递送物增加以后,体系条件也会发生变化,并且可能给细胞带来额外负担。
因此进行电转参数优化时,建议把递送物本身作为独立变量记录,而不是只写一句“加了DNA"。
至少需要知道:
递送的是什么?
加入多少?
总体积是多少?
不同实验批次是否一致?
这样才能进行真正有价值的重复比较。
电转缓冲体系实际上是非常重要的实验变量。
不同缓冲体系的离子组成和导电特性不同,在相同设备设置下,实际放电过程也可能发生变化。
因此,如果更换缓冲液或者改变样品体系,就不能默认以前优化好的电转参数仍然适用。
实验中尤其需要避免一种情况:
参数没有变化,但是今天使用A缓冲液,下次使用B缓冲液,然后直接比较两次实验效率。
这样的数据很容易造成误判。
只写“400V"并不能完整描述一次电转实验。
因为电极之间的距离会影响实际电场条件。
因此正规的电转实验记录,建议至少把:
电压;
波形;
脉冲时间;
脉冲次数;
电转杯间隙;
样品体积;
一起记录。
尤其是在参考文献参数的时候,如果别人使用的电转杯规格与你当前实验不同,直接照搬电压往往并不合适。
这是电转参数优化中非常容易进入的误区。
效率低有很多原因。
可能是脉冲不足,也可能是递送物问题、细胞问题、检测时间问题,甚至可能是电转后恢复过程造成的。
如果没有判断原因,只是持续提高刺激强度,最常见的结果就是:
效率还没有明显提高,细胞死亡先上去了。
Thermo Fisher 的公开资料也指出,电转条件需要在递送效率和细胞存活之间进行平衡,过强的电刺激可能增加细胞损伤。
因此建议采用“小步调整"的方式。
先找到细胞能够接受的大致区域,再逐步缩小范围,而不是一次跨越非常大的参数区间。
有时候电转实际上已经成功,只是检测方法不合适。
例如不同递送物对应的表达或者编辑过程存在时间差异。
如果所有实验统一在同一个时间点检测,可能会错过某些条件真正适合的观察窗口。
因此优化过程中建议设置合理检测节点,并且不要只记录一个最终百分比。
同时观察:
阳性比例;
阳性细胞数量;
细胞活率;
细胞形态;
后续增殖;
必要时再结合功能结果判断。
如果条件很多,不建议漫无目的地一个一个试。
可以采用两轮策略。
第一轮:
寻找大致有效区间。
第二轮:
围绕第一轮表现较好的条件进行细化。
Lonza 的公开优化策略同样采用先进行程序矩阵筛选,再围绕较优条件进行细化,以进一步偏向更高活率或者更高效率。
这种思路的价值就在于:
不用一次把所有排列组合全部做完。
既节约细胞,也节约时间。
对于珍贵样品尤其重要。
如果您的电转实验已经反复调整多次,但仍然存在效率低、活率差、批次波动大或者找不到合适参数窗口的问题,建议不要继续盲目加电压。
把当前的细胞类型、递送物、电转杯规格、缓冲体系、现有参数及实验结果整理出来,再针对问题设计下一轮优化矩阵,通常比继续“碰参数"更有效。